Elle devait être démolie et un nouveau lieu de culte reconstruit à l’arrière de l’église actuelle, le long du boulevard. Le projet, qui prévoyait la restructuration complète de l’îlot avec la création de logements sociaux, ne verra finalement pas le jour. La Ville et le diocèse ont pris la décision de conserver l’église Sainte-Madeleine considérant avec certains experts que sa démolition aurait causé la perte regrettable d’un élément important du patrimoine nantais. Des travaux d’urgence vont être réalisés avant le lancement d’un véritable programme de restauration (travaux pour réparer et remettre en valeur un bâtiment ancien) et de mise en valeur du bâtiment.